tema 02 de 03 · Biología
Genética molecular
Es de los temas que más caen, y esconde un regalo: los problemas de secuencias (de ADN a ARN a proteína) son mecánicos, se resuelven siempre con los mismos pasos y el razonamiento puntúa aunque el resultado final falle. Pocas cosas en el examen son tan rentables.
Qué te va a pedir el examen
- Explicar la replicación del ADN con sus enzimas y sus tres adjetivos: semiconservativa, bidireccional y semidiscontinua.
- Resolver problemas de secuencias: de la hebra molde al ARNm y de ahí al péptido, dejando el razonamiento por escrito.
- Enunciar las características del código genético y usarlas para clasificar el efecto de una mutación.
- Distinguir la expresión génica en procariotas y eucariotas: intrones, exones, splicing.
- Razonar por qué dos células con el mismo ADN son distintas (regulación de la expresión génica).
1 La replicación: copiar el ADN con reglas estrictas
Antes de dividirse, la célula copia su ADN. La replicación se describe con tres adjetivos que conviene dar juntos: es semiconservativa (cada molécula nueva conserva una hebra original, como demostró el experimento de Meselson y Stahl), bidireccional (avanza en los dos sentidos desde cada origen) y semidiscontinua. Este último es el que hay que saber explicar, no solo nombrar.
La clave que lo explica todo: la ADN polimerasa solo sintetiza en sentido 5' a 3'. Como las dos hebras del ADN son antiparalelas, en una puede avanzar de forma continua (la hebra conductora) y en la otra tiene que trabajar a saltos, hacia atrás, en trozos llamados fragmentos de Okazaki que después une la ligasa: es la hebra retardada. De ahí lo de semidiscontinua. Si te piden justificarlo, esa es la respuesta completa, y son cuatro líneas.
Del reparto de enzimas, quédate con la lógica: la helicasa abre la doble hélice, la primasa fabrica un cebador de ARN (la polimerasa no sabe empezar de cero), la ADN polimerasa sintetiza la hebra nueva y corrige errores, y la ligasa une los fragmentos. Un apunte que evita un despiste frecuente: los telómeros, los extremos que se acortan con cada división, son exclusivos de eucariotas; el cromosoma procariota es circular y no tiene extremos que acortar.
2 Del gen a la proteína: transcripción y maduración
El dogma central ordena el tema entero: ADN, transcripción, ARN, traducción, proteína. Cuando te pregunten por cualquier proceso, sitúalo en ese mapa: qué molécula entra, cuál sale y qué enzima trabaja.
La transcripción es la síntesis de ARN a partir de una hebra molde de ADN; la hace la ARN polimerasa, que a diferencia de la ADN polimerasa no necesita cebador. En procariotas ocurre en el citoplasma y puede solaparse con la traducción; en eucariotas ocurre en el núcleo y el ARN sale ya maduro.
Esa maduración es materia de examen: en eucariotas los genes tienen intrones (no codificantes) y exones (codificantes), y el splicing elimina los intrones y empalma los exones, dentro del núcleo. Se añaden además la caperuza en el extremo 5' y la cola poli-A en el 3', que protegen el mensajero. Un truco de memoria que funciona: exón es el que se expresa.
Y una idea que luce en las respuestas: el splicing alternativo permite que un mismo gen produzca varias proteínas distintas según qué exones se conserven. Es una de las razones de que tengamos muchas más proteínas que genes.
3 El código genético y la traducción
El código genético es la correspondencia entre codones (tripletes de nucleótidos del ARNm) y aminoácidos. Sus características se preguntan tal cual: es universal (prácticamente el mismo en todos los seres vivos), degenerado (varios codones pueden codificar el mismo aminoácido: hay 64 codones para 20 aminoácidos), no ambiguo (cada codón codifica un único aminoácido) y de lectura continua, sin solapamientos ni comas.
Cuidado con el sentido de la degeneración, porque es el error más citado del tema: degenerado significa varios codones para un aminoácido, nunca al revés. Un codón jamás especifica dos aminoácidos distintos; por eso el código es a la vez degenerado y no ambiguo, sin contradicción. Como un idioma con sinónimos: varias palabras significan lo mismo, pero cada palabra tiene un solo significado.
Los codones especiales hay que saberlos: AUG es el de inicio (y codifica metionina); UAA, UAG y UGA son de parada y no codifican ningún aminoácido. La traducción ocurre en los ribosomas: el ARNt reconoce cada codón con su anticodón complementario, aporta el aminoácido, se forma el enlace peptídico y el ribosoma avanza codón a codón hasta el primer stop.
4 El problema de secuencias, paso a paso
El ejercicio tipo te da una secuencia de ADN y te pide el ARNm y el péptido. El método es siempre el mismo. Paso uno: identifica qué hebra te han dado, y dilo por escrito. La hebra molde es la que se lee para transcribir: el ARNm es complementario a ella. La codificante es la otra: el ARNm es idéntico a ella cambiando T por U. Confundirlas es el fallo que arruina el problema entero.
Paso dos: transcribe respetando dos reglas: el ARNm se escribe en sentido 5' a 3' (vigila la polaridad, las hebras son antiparalelas) y lleva U en lugar de T. Paso tres: traduce leyendo de tres en tres desde el AUG, no desde la primera base, y detente en el primer codón de parada que esté en el mismo marco de lectura. El stop no cuenta como aminoácido.
Si el problema añade una mutación, razona con el código delante: si el codón nuevo da el mismo aminoácido, la mutación es silenciosa (gracias a la degeneración); si da otro, es de sentido erróneo; si aparece un stop prematuro, es sin sentido y la proteína queda truncada. Y si se inserta o elimina un número de bases que no sea múltiplo de tres, se corre el marco de lectura y cambia todo lo que viene después: es la más grave. Fíjate en la condición: una deleción de tres bases quita un aminoácido, pero no descuadra la lectura.
5 Mutaciones y regulación: cuando el texto falla y cómo se administra
Una mutación es una alteración del material genético que puede transmitirse. Por extensión, las hay génicas (una o pocas bases), cromosómicas (la estructura del cromosoma: deleciones, inversiones, translocaciones) y genómicas (el número de cromosomas: aneuploidías como la trisomía 21, y poliploidías).
Sobre sus consecuencias, huye del sí o el no rotundos: la mayoría son neutras o perjudiciales (enfermedades, cáncer), pero las mutaciones son también la fuente primaria de variabilidad genética y, por tanto, la materia prima de la evolución por selección natural. Ese matiz de doble cara es exactamente lo que el corrector espera leer, y es lo que más se olvida.
Queda la pregunta más elegante del tema: si todas tus células tienen el mismo ADN, ¿por qué una neurona no se parece en nada a un hepatocito? Porque lo que distingue a cada tipo celular no es qué genes tiene, sino cuáles expresa. La expresión se regula, sobre todo, por el grado de condensación de la cromatina: la eucromatina, descondensada, es accesible y sus genes pueden transcribirse; la heterocromatina, muy condensada, está silenciada. Además intervienen factores de transcripción sobre el promotor y el propio splicing alternativo.
Para llevarte
- La ADN polimerasa solo sintetiza en sentido 5' a 3': de ahí la hebra retardada, los fragmentos de Okazaki y el adjetivo «semidiscontinua».
- Di siempre por escrito qué hebra usas: el ARNm es complementario a la molde e idéntico a la codificante (con U en lugar de T).
- Degenerado no es ambiguo: varios codones por aminoácido, pero cada codón un único aminoácido.
- Los codones de parada no codifican nada: no los cuentes al calcular la longitud del péptido.
- Una inserción o deleción solo corre el marco de lectura si el número de bases no es múltiplo de tres.
- Todas tus células tienen el mismo ADN: lo que las diferencia es qué genes expresan, y eso depende del estado de la cromatina.
Errores que restan
- Confundir la hebra molde con la codificante, o perder la polaridad antiparalela al transcribir.
- Contar el codón de parada como aminoácido, u olvidar que el ARN lleva U y no T.
- Invertir la degeneración del código («cada aminoácido tiene un solo codón») o llamarlo ambiguo.
- Situar el splicing en el citoplasma: ocurre en el núcleo, y solo en eucariotas.
- Dejar un problema en blanco: el razonamiento escrito puntúa aunque el resultado final falle.
Autochequeo
Responde sin mirar arriba. Si fallas, mejor aquí que el día del examen: cada opción trae su porqué.
1. ¿Por qué en la replicación existe una hebra retardada que se sintetiza en fragmentos de Okazaki?
La polimerasa no tiene dos modos de trabajo: siempre sintetiza en 5' a 3'. Como las hebras del ADN son antiparalelas, en una avanza de forma continua y en la otra se ve obligada a ir a saltos, en fragmentos que la ligasa une después. Decir que la polimerasa sintetiza en 3' a 5' es justo el error que este razonamiento desmonta.
2. Que el código genético sea degenerado significa que...
Hay 64 codones para 20 aminoácidos, así que a muchos aminoácidos les llegan varios codones: eso es la degeneración. La relación inversa no se cumple jamás: cada codón codifica un único aminoácido (el código no es ambiguo), y además es prácticamente universal, no cambia entre especies.
3. Un ARNm tiene la secuencia 5'-AUG UUU UGA GCA-3'. ¿Cuántos aminoácidos tiene el péptido que se traduce?
La traducción empieza en el AUG (metionina), sigue con UUU (fenilalanina) y se detiene en UGA, que es un codón de parada: no codifica ningún aminoácido, solo detiene el proceso, y el GCA posterior ya no se lee. Contar el stop como aminoácido es el despiste clásico de estos problemas.
4. El splicing es un proceso que...
El splicing es parte de la maduración del ARNm eucariota: quita los intrones (no codificantes) y une los exones (los que se expresan), y ocurre dentro del núcleo, antes de que el mensajero salga al citoplasma. Situarlo en el citoplasma, atribuirlo a procariotas o invertir intrón y exón son los tres errores que más se repiten aquí.
5. Una neurona y un hepatocito del mismo organismo son muy distintos porque...
Todas las células de un organismo comparten el genoma completo: la diferencia está en la regulación de la expresión, sobre todo en qué regiones de la cromatina están accesibles (eucromatina) o silenciadas (heterocromatina). No hay pérdida de genes ni ADN distinto por tejido, y las mutaciones no explican la diferenciación normal.
La pregunta que decide si lo tienes
Dada la hebra molde de ADN 3'-TAC GGA ATT ACT-5', escribe el ARNm que se transcribe y razona cuántos aminoácidos tiene el péptido resultante.
Pista 1
El ARNm es complementario a la hebra molde y antiparalelo a ella: escríbelo en sentido 5' a 3' y recuerda que en el ARN no hay timina, hay uracilo.
Pista 2
Lee el mensajero de tres en tres desde el codón de inicio y párate en el primer codón de parada que encuentres en ese marco de lectura. Antes de contar, pregúntate: ¿el codón de parada codifica algún aminoácido?
Solución
Primero se transcribe complementando la hebra molde y cambiando T por U, en sentido antiparalelo: frente a 3'-TAC GGA ATT ACT-5' se obtiene el ARNm 5'-AUG CCU UAA UGA-3'. Después se lee en tripletes desde el codón de inicio: AUG codifica metionina, CCU codifica prolina, y el tercer codón, UAA, es de parada, así que la traducción termina ahí y el UGA posterior ni siquiera se lee. El péptido tiene por tanto dos aminoácidos, metionina y prolina. Conviene dejar escrito el porqué: los codones de parada no codifican ningún aminoácido, solo detienen la traducción, y por eso no se cuentan. Y fíjate en cuánto puntúa el orden del razonamiento: qué hebra usas, la transcripción con U, la lectura desde AUG y la parada en el primer stop. Aunque un paso saliera mal, todo lo demás sigue sumando.